Tuja smaragd je zeleno stablo iz porodice čempresovki (Cupressaceae). Kora joj je crveno smeđa i uzdužno se guli u trakama. Ima plošne ljuske tupo zaobljene na sredini s krupnom, okruglastom, izbočenom smolnom žlijezdom. Cvate od ožujka do svibnja.
Muški cvijetovi su smješteni na kratkim peteljkama, tamno crvene boje i sitne strukture.
Ženski češeri su veličine 1cm, nalaze se na dršci dugoj oko 5mm. U fazi dozrijevanja poprima tamno smeđu boju. Ima svijetlo zelene listove koji sadržavaju boju i kroz zimske mjesece.